
Зелени Балкани има доказан опит в възстановяването и управлението на влажни зони в България. НПО провежда дългосрочна програма за опазване на Поморийското езеро от 1996 г. Разнообразни мерки за опазване на видове птици, възстановяване на местообитанията и хидрологичния режим, създаване на посетителски център, почистване на незаконно изхвърлените битови и строителни отпадъци и събиране през тези години беше осъществена обществената осведоменост за сайта. Една от най-успешните дейности беше възстановяването на местообитания на редки и защитени колониално размножаващи се видове водолюбиви птици (сандвич, обикновена и малка рибарка, авоцети, чернокрили кокили, кентишки площи), което доведе до стабилизиране на техните гнездови популации в Поморийското езеро. В периода 2008-2010 г. е изготвен и представен през 2014 г. Интегриран план за управление на Поморийското езеро (национална защитена зона, SCI & SPA, площадка Рамсар). Той все още не е одобрен от компетентния орган-МОСВ.
Зелени Балкани е участвал като асоцииран бенефициент в проекта MC SALT LIFE10 / NAT / IT / 256, занимаващ се с опазване и поддържане на FCS на птици и местообитания в девет обекта от Натура 2000 (всички те са домакини на солни работи), разположени в Италия, Франция и България. GB е координиращ бенефициент по проект „Натура 2000 в България - Нови хоризонти“ LIFE17 GIE / BG / 371.